• Réduire le texte

    Réduire le texte
  • Rétablir taille du texte

    Rétablir taille du texte
  • Augmenter le texte

    Augmenter le texte
  • Imprimer

    Imprimer
Rangées de graines.. © Inra, Elena Schweitzer © Fotolia

Nos résultats

Sommaire
  1. Introduction
  2. Recherches et Innovations 2018 - Pour l'Aliment et les Bioproduits
  3. Jambon sec : un simulateur de procédé permet de définir des itinéraires de fabrication conduisant à l’élaboration de produits moins salés
  4. La manière dont les protéines s’agrègent lors d’un traitement thermique module leur capacité sensibilisante
  5. Accroître la survie des probiotiques au séchage en stimulant leur adaptation aux stress
  6. Impact des traitements thermiques sur la digestion du lait maternel chez le nourrisson prématuré
  7. Recherches et Innovations 2017 - Pour l'Aliment et les Bioproduits
  8. Le pouvoir adhésif deLactococcus lactis: une histoire tirée par les « pili » ?
  9. Quand les biopolymères s'assemblent : un jeu d'énergie et d'entropie.
  10. Toute la digestion gastro-intestinale dans un laboratoire sur puce : le microdigesteur
  11. Dis, comment une goutte de lait devient-elle un grain de poudre ?
  12. Recherches et Innovations 2016 - Pour l'Aliment et les Bioproduits
  13. 13 minutes pour tout savoir sur la qualité des fromages et des recherches qu'elle implique
  14. Un nouveau procédé pour le bio-raffinage du végétal
  15. La membrane bactérienne sous la lumière UV du synchrotron SOLEIL
  16. L’ingénierie inverse ou la machine à remonter… le pain !
  17. Chimie verte : Améliorer la production de lipides chez la levure
  18. Des vins de qualité à teneur réduite en alcool acceptés par le consommateur
  19. Impact des procédés de fractionnement sur la distribution des mycotoxines dans le blé dur
  20. Pâtes aux légumineuses : comment la formule et le procédé confèrent à l’aliment ses qualités nutritionnelles
  21. Contrôler le brunissement des vins blancs par la sélection raisonnée de levures
  22. Des bactéries lactiques pour réduire l’allergénicité de certaines protéines du lait
  23. Eliminer les biofilms avec un détergent enzymatique : une alternative aux traitements à base de soude
  24. Néo-enzymes à façon pour la conception de vaccins antibactériens
  25. RMN : une méthode non destructive pour identifier et quantifier les molécules phosphorées
  26. Marché des viandes transformées : vers une méthode de référence ?
  27. Modélisation mécanique multi-échelle : de l’échelle nanométrique aux propriétés macroscopiques de la mie de pain
  28. Minimoulin : 500 g pour apprécier la valeur meunière des blés
  29. Production microbienne de lipides à usages énergétiques ou chimiques
  30. L'acide férulique, acteur discret mais universel de la construction des parois lignifiées
  31. Eco-conception de matériaux à base de co-produits du bois
  32. L'analyse des composés volatils pourrait permettre d'authentifier le système de production des poulets
  33. Des nanoparticules comme marqueurs de biopolymères en microscopie
  34. Pasteurisation, UHT, microfiltration... Tous les traitements n'ont pas le même impact sur la qualité nutritionnelle du lait
  35. Des rayons X pour caractériser les couches accumulées lors des opérations de filtration
  36. L'intégration des connaissances expertes appliquées à l'affinage des camemberts
  37. Maîtriser la perte de masse des fromages pendant l'affinage
  38. La mémoire de l'amidon
  39. Recherches et innovations 2015 - Pour l'Aliment et les Bioproduits
  40. Comportement des micelles de caséine lors de la filtration du lait
  41. Nouvelle enzyme de dégradation des pectines
  42. Digestion du nourrisson : un modèle permet d’étudier les allergènes alimentaires
  43. Digestion des protéines carnées
  44. Des émulsions modèles de la digestion révèlent l’effet protecteur des polyphénols
  45. Perception de l’astringence : un nouvel éclairage grâce à la spectrométrie de masse
  46. Hautes pressions : Nouvelles voies d'utilisation et de valorisation sur les aliments emballés
  47. Fours à injection de vapeur d’eau : jusqu'à 12% d’économie d’énergie
  48. Nouvelle méthode d’analyse rapide de la qualité des tomates et des abricots
  49. Jambon de Bayonne : des marqueurs de texture et d’arôme pour maîtriser la qualité
  50. Suraccumulation de lipides chez la levure S. cerevisiae : vers une production de biocarburants à usage aéronautique
  51. Fractionner la ventilation des hâloirs de fromagerie : 50% d’économie d’énergie
  52. Connaître la structure de l'amidon pour maîtriser ses applications
  53. L’IRM pondérée en diffusion : un outil générique pour la micro-imagerie des lipides dans les matrices alimentaires
  54. Caractérisation d’un gène majeur de la biosynthèse des anthocyanes dans la baie de raisin
  55. Nouveaux détecteurs d’activités enzymatiques à base de nanocouches semi-réflectives de biopolymères
  56. Vers la connaissance de la structure de la micelle de caséine
  57. Le chauffage du lait semble favoriser le développement de l’allergie chez les nourrissons
  58. Mieux comprendre le pouvoir moussant des protéines en étudiant leur comportement aux interfaces eau-air
  59. Nouveau modèle d’organisation en 3D de la membrane de globules gras du lait
  60. Comment les protéines alimentaires s’auto-assemblent en objets micrométriques
  61. Une nouvelle méthode de séparation permet de déterminer la structure complète de biopolymères
  62. Intérêt des métabolites volatils des produits carnés pour révéler les contaminations des animaux d’élevage aux micropolluants environnementaux
  63. SensinMouth quand le goût fait sens
  64. Un logiciel d’aide au choix d’un emballage pour la filière Fruits et Légumes frais construit sur une démarche d’ingénierie des connaissances
  65. SOLEIL nous éclaire sur la structure des protéines stabilisatrices des réserves lipidiques de plantes oléagineuses
  66. Un zoom sur le processus d’assemblage multi-échelle des protéines 
  67. Maîtrise du séchage de produits laitiers infantiles par la prise en compte des interactions eau-constituants
  68. Maîtriser l’acidité du vin par un procédé électro-membranaire : une nouvelle pratique œnologique autorisée en Europe et dans les pays viticoles du nouveau monde
  69. Stratégies de réduction du taux de sodium dans les aliments
  70. Pour une meilleure persistance de Lactococcus lactis dans le tractus digestif
  71. L’allergie alimentaire au blé : une histoire d’épitopes
  72. Des essais sur un modèle de souris allergiques révèlent le fort potentiel allergisant d’un procédé alimentaire : la désamidation du gluten de blé
  73. Protéger les lipides omega-3 de l’oxydation : le rôle clé des émulsifiants
  74. Quel impact de la cuisson sur la qualité des viandes ? Des images aux modèles mathématiques.
  75. Comment améliorer le pouvoir moussant des protéines ?
  76. Une cellule d’observation sous cisaillement de gels, mousses, pâtes et autres systèmes complexes
  77. Vers une compréhension des mécanismes impliqués dans la synthèse de tanins astringents
  78. Fractionnement du lait : des procédés membranaires éco-performants
  79. Qualité des vins : de l'oxygène un peu, beaucoup, ... pas du tout ?
  80. Obtenir des émulsions très stables sans tensioactifs grâce à des nanocristaux de polysaccharides issus de la biomasse.
  81. Découverte de nouvelles enzymes de dégradation des polysaccharides végétaux dans le microbiome intestinal humain
  82. La cutine de la peau des tomates pour de nouveaux polymères
  83. La texture des fruits : phénotypage et chémotypage de déterminants histologiques et pariétaux
  84. Simulation de la fragmentation orale d'aliments céréaliers fragiles ... Scrountch !
  85. La déglutition, un carrefour physiologique clé pour libérer les arômes 
  86. Un nouveau procédé de cuisson des viandes sous dioxyde de carbone pour réduire l'apparition de composés indésirables
  87. Dénaturation thermique des protéines musculaires par microspectroscopie FT IR localisée couplée au rayonnement synchrotron
  88. Des résines époxy biosourcées, sans bisphénol A, à partir de polyphénols naturels
  89. Structure d'un colloïde naturel : la micelle de caséine du lait
  90. Identification d'une souche d'Aspergillus qui améliore de 20% le rendement en glucose de la biomasse en conditions industrielles
  91. Une enzyme impliquée dans la polymérisation de la cutine
  92. Une farine de blé dur adaptée à la fabrication de baguettes traditionnelles
  93. Le virtuel pour guider la construction d’enzymes « sur mesure »
  94. Jusqu’où est-il possible de réduire la teneur en sel dans les charcuteries cuites ?
  95. Diffusion des molécules organiques dans les matériaux polymères : retour sur les lois connues
  96. Mousse intelligente : différentes manières de détruire une mousse sur demande !
  97. La Datte, riche en tanins et pourtant ni amère ni astringente
  98. Réduire la teneur en sel des aliments
  99. Recherches et innovations 2014

Néo-enzymes à façon pour la conception de vaccins antibactériens

La shigellose est une des infections entériques d’origine bactérienne parmi les plus dévastatrices dans les pays du tiers monde. Sa prévention s’oriente, entre autres, vers la conception de vaccins antibactériens glycoconjugués, comportant une partie glucidique mimant les motifs moléculaires retrouvés à la surface des bactéries pathogènes. Ces glucides complexes sont capables de stimuler la réponse immunitaire mais par synthèse chimique relève de processus délicats à mettre en oeuvre. Face à ces difficultés, les chercheurs ont imaginé de nouvelles voies de synthèse chimio-enzymatiques. Pour mener à bien leur projet, ils ont réussi à construire de nouvelles enzymes parfaitement adaptées pour catalyser les réactions de synthèse ciblées. Il s’agit du tout premier exemple de création de nouvelle spécificité pour cette famille de catalyseurs. Cette approche souligne le remarquable potentiel des nouvelles techniques d’ingénierie des protéines pour l’obtention d’enzymes façonnées à la demande, notamment pour le développement de nouvelles voies chimio-enzymatiques de synthèse.

La glycochimie comme piste de production vaccins antibactériens

La shigellose est une des infections entériques les plus dévastatrices dans les pays du tiers monde. La prévention de la maladie s’oriente entre autres vers la conception de vaccins glycoconjugués dits de nouvelle génération utilisant les propriétés antigéniques d’oligosides synthétiques mimant le lipopolysaccharide des bactéries responsables de la maladie.
La synthèse chimique de ces oligosides est difficile. Pour contourner ces difficultés, le recours aux catalyseurs enzymatiques est une alternative possible. Cependant, la spécificité des enzymes sauvages n’est pas toujours compatible avec la transformation de substrats non naturels, porteurs de groupements fonctionnels autorisant leur modification chimique ultérieure.

Le développement de nouvelles voies chimio-enzymatiques exige donc la génération de nouvelles enzymes parfaitement adaptés à la fonction désirée. Dans cette optique, la stratégie envisagée en collaboration avec L. Mulard (Institut Pasteur) dans le cadre du projet ANR OptiGluc a consisté à concevoir des voies de synthèse chimio-enzymatique d’antigènes osidiques faisant intervenir une étape de 1,2-cis glucosylation enzymatique.
Aucune enzyme sauvage disponible n’étant capable de catalyser efficacement la réaction, le défi a consisté à créer de nouvelles enzymes par ingénierie semi-rationnelle.

Obtenir par synthèse chimio-enzymatique la composante saccharidique des vaccins

La synthèse chimio-enzymatique des deux motifs antigéniques sélectionnés impliquait la production des dérivés glucosylés de l’All-α-D-GlNac (allyl 2-N-acetyl-2-deoxy-α-D-glucopyranoside)  et le méthyl α-L-rhamnopyranoside (methyl α-L-rhamnopyranoside). Pour réaliser ces synthèses, notre choix s’est porté sur l’amylosaccharase, une transglucosidase qui utilise comme donneur de glucose un substrat abondant et très peu couteux, le saccharose. L’enzyme naturelle catalyse la synthèse de l’Allyl-αDGlcp-(1→4)-αDGlcNAc avec un rendement inférieur à 6% et ne reconnaît pas l’α-methyl-Lrhamnose pour produire le Me-αDGlcp-(1→3)-αLRhap.
Le remodelage du catalyseur présentait un double challenge : conserver la spécificité envers le substrat donneur et créer des catalyseurs efficaces et adaptés à la glucosylation régiospécifique des accepteurs. Une stratégie de remodelage raisonné du site de liaison de l’accepteur couplant la modélisation moléculaire à la mutagénèse semi-aléatoire a été adoptée. Par analyse in silico des complexes enzyme:accepteur non naturel, sept acides aminés cibles ont été identifiés puis systématiquement remplacés par les 19 substituants possibles. La banque obtenue, comptant 133 mutants, a été criblée pour les deux réactions d’intérêt. Plusieurs mutants capables de reconnaître le méthyl αL-Rhamnopyranoside et de le glucosyler ont ainsi été isolés.
Figure 1: Réaction enzymatique ciblée dans la voie de synthèse chimio-enzymatique  de motifs antigéniques mimant le lipopolysaccharide des bactéries S. flexneri sérotypes 3a et 1b.. © Inra
Figure 1: Réaction enzymatique ciblée dans la voie de synthèse chimio-enzymatique de motifs antigéniques mimant le lipopolysaccharide des bactéries S. flexneri sérotypes 3a et 1b. © Inra

Il s’agit du tout premier exemple de création de nouvelle spécificité pour cette famille d’enzymes et plus largement pour les α-transglycosidases. Concernant, la glucosylation de l’allyl-αD-N-acetyl-Glucosamine, des mutants 130 fois plus efficaces que l’enzyme sauvage ont été obtenus qui glucosylent cet accepteur avec des rendements de plus de 80%. Ces néoenzymes ont été employées dans les voies chimio-enzymatiques programmées permettant de valider avec succès la stratégie initialement proposée. Deux brevets ont été déposés suite à cette étude.

De nouvelles perspectives en santé humaine

Focalisée sur Shigella flexneri, une cible d’intérêt majeur en santé humaine, notre approche démontre la pertinence des stratégies de synthèse innovantes en glycochimie, employant des enzymes façonnées à la demande. Nos efforts vont maintenant être concentrés sur l’analyse structurale des variants améliorés et le développement de techniques innovantes de criblage virtuel permettant d’optimiser la création de néoenzymes.

Partenaires

Institut Pasteur, Unité de Chimie des Biomolécules (URA CNRS 2128)

En savoir plus

  • Champion E, André I, Moulis C, Boutet J, Descroix K, Morel S, Monsan P, Mulard LA, Remaud-Simeon M. 2009a. Design of alpha-transglucosidases of controlled specificity for programmed chemoenzymatic synthesis of antigenic oligosaccharides. J Am Chem Soc 131(21):7379-89. (JCR = 8.091)
  • Champion E, André I, Mulard LA, Monsan P, Remaud-Siméon M, Morel S. 2009b. Synthesis of L-rhamnose and N-acetyl-D-glucosamine derivatives entering in the composition of bacterial polysaccharides by use of glucansucrases . J Carbohydr Chem 28:142-159. (JCR = 1.114)
  • CHAMPION E., ANDRÉ I., MOULIS C., MOREL S., MONSAN P., BOUTET J., MULARD L., REMAUD-SIMÉON M. (2008) Mutants of Glycoside hydrolases and uses thereof for synthesizing complex oligosaccharides and disaccharide intermediates. EP08 290 238.8// PCT/IB2009/005343
  • CHAMPION E., ANDRÉ I., MOULIS C., MOREL S., MONSAN P., DESCROIX K., MULARD L., REMAUD-SIMÉON M. (2008) Mutants of Amylosucrase and uses thereof for synthesizing complex oligosaccharides and disaccharide intermediates. EP08 290 237.0// PCT/IB2009/005325